【武漢肺炎研究 4】陰謀論?人造病毒有可能嗎?Spike Protein-ACE2 Docking

武漢肺炎病毒出現的源頭到今仍是個謎,已經有美國專家提出警告,病毒可能是人為的生化武器,是從武漢的 P4 實驗室散播出來。由於大眾對人造病毒的疑慮一直沒停過,因此我們想了解武漢肺炎的感染途徑是否和SARS 相同?

在之前的研究中,我們發現了武漢肺炎和 SARS 在 Spike Protein 的基因序列有差異,會造成雙方感染機制的差異。我們也再進一步用 Muscle(Multiple Sequence Alignment Tool)來比對蛋白質序列,發現 2019-nCoV 和 SARS-CoV 的 Spike Protein 在結合上,有 25%的相異度。我們好奇的是,這 25%的差異是否因人為因素改變了蛋白質的結合?

為了探討這個問題,我們先使用 Swiss-model,並以 SARS-CoV 的 Spike Protein 做為模板,模擬出武漢肺炎病毒的 Spike Protein。最後用 Zdock 將個別的 Spike Protein 和 ACE2 做親和力預測,ACE2 是已知 SARS 病毒進入人類細胞所辨認的膜蛋白。

最後我們的預測結果顯示,不管是武漢肺炎,還是 SARS,兩者病毒都對 ACE2 有好的親和力,但 SARS-CoV 相較於 2019-nCoV 的 Spike Protein,親和力更為顯著。